知网查重和免费查重工具在使用方法、查重准确度、文献来源等方面存在明显差异。知网查重是基于知网数据库进行查重，准确度高，但需要付费使用；而免费查重工具通常是基于公开数据库，准确度相对较低，但免费使用。在实际选择时，应根据具体需求和经济能力进行权衡。

知网查重和免费查重工具在使用方式和效果上有显著的差异。知网查重是基于知网数据库的专业查重服务，准确度高，但需要付费；免费查重工具通常基于公开数据库，准确度较低，但免费使用。用户在选择时应根据需求和经济条件综合考虑。