进行论文查重降重时，首先要选择一款专业的查重软件，如知网、万方等。其次，要注意论文格式的规范性，避免出现格式错误导致查重不准确的情况。另外，可以适当运用同义词替换、改变句式结构等方式进行降重，但要保持原意不变。最后，查重完成后，及时保存查重报告，以备日后学术成果保护之需。

在进行论文查重降重后，如何保护学术成果是关键问题。首先，建议及时在学术平台上发布论文，确立学术优先权。其次，可以考虑申请专利保护，将独特的研究成果得到法律保护。此外，加强学术交流，提高学术影响力也是一种保护学术成果的方式。最重要的是，树立学术诚信意识，严禁抄袭、剽窃行为，维护学术界的正常秩序。