学术机构合作知网查重费用优惠的流程包括以下几个步骤：首先，学术机构需要与知网进行合作协商，确定合作方式和内容。其次，双方达成合作意向后，学术机构提交相关资料进行查重。然后，知网根据查重结果和合作协议给出费用优惠方案。最后，学术机构确认费用优惠方案并支付费用，完成合作流程。

在学术机构合作知网查重过程中，费用优惠是一项重要的考量因素。学术机构可以通过与知网合作获得一定的费用优惠，降低查重成本。同时，合作过程中的流程也影响着费用优惠的具体情况，因此学术机构需要了解清楚整个合作流程，以便获得最大的费用优惠。通过合作，学术机构可以获得高质量的查重服务，提升学术研究水平。